Soul Eater ruota attorno agli studenti della Shinigami Buki Shokunin Senmon Gakkō
(chiamata più comunemente con il nome di Shibusen),una scuola professionale per
Shokunin (artigiani/meister) e le loro buki (armi demoniache che possono assumere la sembianza umana).
La scuola è stata creata da Shinigami-sama, il Dio della Morte, che assolve anche alla funzione di preside.
Ogni Shokunin combatte con una buki, sua compagna. Lo scopo finale della scuola è di
mantenere la pace ed impedire che sorga un nuovo kishin: un meister demoniaco che ha quasi fatto
sprofondare il mondo nel caos.
A tal proposito gli studenti della scuola raccolgono le uova di kishin, che sono le anime umane malvagie,
e le danno in pasto alle loro buki. Assorbite 99 anime più quella di una strega, la buki diventa un'arma
potente (Death Scythe)che potrà essere usata da Shinigami-sama.
Ovviamente per far in modo che gli studenti siano in grado di affrontare tale compito, meister e buki
frequentano la scuola e le lezioni supplementari.
Durante il loro apprendistato, gli studenti, oltre a frequentare i corsi, possono affrontare le missioni che
Shinigami-sama ordina loro.
Quasi sempre si tratta di fronteggiare un nemico per poi poterne mangiare l'anima.